Родился 27 января 1980 в г. Москве, в семье теннисистов - спортсменов и тренеров. Отец - Мубин Алямшеевич (Михаил Алексеевич) Сафин, мать - Рауза Исланова.
Познакомился с теннисом в возрасте 5 месяцев. Первым тренером была его мать, которая в то время преподавала теннис в клубе "Спартак".
В 1990 Сафин в составе группы юных теннисистов из России (в которую входила и Анна Курникова) поступил в Теннисную академию (Цинциннати, США), но вскоре вернулся на родину.
В 1994 уехал в Испанию и был принят в Теннисную академию Панчо Альварина в Валенсии. Там он обучался под руководством Рафаэля Менсуа.
В 1997 Сафин завоевал свой первый титул, победив в теннисном турнире из серии "Челленджерс" в г. Эспино, а в ноябре 1997 состоялся дебют Марата в АТP-туре - на Кубке Кремля...